This press release is available in English at the University of Gothenburg website.
Inhibitorer för behandling
Genom att PPS är specialiserade på proteinproduktion har vi exempelvis kunnat ta fram och kartlägga strukturen hos olika proteiner från SARS-CoV-2-viruset. På flera orter har vi producerat det viktiga SARS-CoV-2 proteaset (Mpro) som behövs för att hitta inhibitorer som kan fungera som möjliga läkemedel, säger Uwe Sauer, universitetslektor och koordinator för Protein Expertis Plattformen (PEP), Umeå universitet.
I en studie från oktober 2020, har forskare på Lunds universitet kunnat studera inhibitorer med hjälp av virusproteiner producerade av Lund Protein Production Platform (LP3).
I studien kartlades det specifika proteinet nsp10 och det kan hjälpa till att dels förstå hur viruset replikerar sig men också för att hitta inhibitorer som kan påverka proteinet och därmed viruset.
Förstå coronavirusets spikar
Coronavirusets kända spikar, som sitter som knoppar på viruspartikeln, består även de av proteiner och har kunnat produceras på flera laboratorier, bland annat på MPE Core Facility vid Sahlgrenska Akademin i Göteborg. Det har möjliggjort för forskare på Sahlgrenska Akademin att identifiera antikroppar mot viruset – även hos patienter som genom andra metoder testats negativt för infektion.
Det är genom spik-proteinerna som viruset fäster till människans egna celler och kan därmed överföra smittan. Antikroppar är därför viktiga för att förhindra virusets spridning mellan celler.
Inom alla proteinplattformar i Sverige har vi en hög ambition att använda vår expertis och utrustning för en snabb respons på de utmaningar som den pågående pandemin ställer, men vi ser också att de kunskaper vi får kan användas för framtida ännu okända virus, säger Malin Bäckström, enhetschef på MPE i Göteborg.
Unikt svenskt samarbete
Proteinfaciliteterna i Sverige samarbetar genom sitt nationella nätverk PPS. Det svenska samarbetet är unikt i Europa, menar Wolfgang Knecht, universitetslektor på Lunds Universitetet och manager på LP3.
Så vitt vi vet så finns inget liknande universitetssamarbete på nationell nivå i andra länder i Europa.
Sedan 2013 när PPS nätverket grundades har plattformarna tillsammans kunnat ge högkvalitativt forskningsstöd till en lång rad forskare inom olika fält, och vi har nu särskilt fokus på projekt som rör SARS-CoV-2, säger Wolfgang Knecht.
Fakta: fem områden inom COVID-19-forskningen där proteinproduktion varit centralt för att öka kunskapen om viruset:
-
Serologi, dvs att mäta förekomsten av antikroppar hos patienter. Har genomförts vid Göteborgs universitet samt Stockholms universitet/SciLifeLab.
-
Testning av antikroppar som utvecklats mot SARS-CoV-2 för terapi eller diagnostik, med hjälp av proteiner som producerats inom PPS. Referens: Genomförts på Stockholms universitet/SciLifeLab.
-
Produktion av det viktigaste SARS-CoV-2 virus-proteaset (Mpro) för att hitta inhibitorer som kan fungera som läkemedelskandidater och för dess strukturbestämning. Genomförts på Karolinska institutet samt Umeå universitet.
-
Produktion av olika polymeraser för användning i PCR-diagnostik för SARS-CoV-2 viruset. Genomförts på Karolinska institutet samt Umeå universitet.
-
Strukturbestämning av olika proteiner från SARS-CoV-2. Genomförts på Lunds universitet och Karolinska institutet.
Proteinproduktionsenheterna inom PPS:
- Lunds universitet: Lund Protein Production Platform, LP3
- Karolinska Institutet: Protein Science Facility, PSF (external website)
- Umeå Universitet: Protein Expertise Platform, PEP (external website)
- Göteborgs universitet: Mammalian Protein Expression Core Facility, MPE (external website)
- Göteborgs universitet: Swedish NMR Center (external website)
- Stockholms universitet/SciLifeLab: Eukaryotic Protein Production, EPP (external website)
Tre publicerade artiklar:
- Marklund et al. Serum-IgG responses to SARS-CoV-2 after mild and severe COVID-19 infection and analysis of IgG non-responders (external website) PLoS One 2020 Oct 21;15(10):e0241104.
- Alekseenko et al. Detection of SARS-CoV-2 using non-commercial RT-LAMP regents and raw samples (external website). Scientific Reports 11 2021
- Rogstam et al. Crystal Structure of Non-Structural Protein 10 from Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (external website) Int J Mol Sci 2020 Oct 6;21(19):7375.
